第一本肯定是《神農本草經》，然後《本草經集注》、 《唐本草》(《新修本草》) 、《證類本草》 、《本草綱目》 、《本草綱目拾遺》 。現存最出名的就這六本。
還有《開寶本草》、《日華子本草》、《嘉佑本草》等是佚書，但在别的書裡還能找到這些書裡的内容。《雷公炮炙論》也很出名但主要講中藥炮制。
其他還有《本草衍義》、《湯液本草》、《蜀本草》、《滇南本草》等，然後民國時候有《中國藥學大辭典》，新中國有《中華本草》、《中華人民共和國藥典》等。
要是把其它方面的也算上那《傷寒論》、《金貴要略》、《千金方》、《瘟病條辨》、《醫方集解》等也是經典著作。